Description de l’établissement :

Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Ses 5 000 employés et ses 500 médecins, dentistes et pharmaciens œuvrent dans un milieu à la fois hautement innovant, où des connaissances sont générées et partagées au quotidien, et respectueux des personnes, plaçant le patient et sa famille au cœur de la pratique. Associé à l'Université de Montréal, le CHU Sainte-Justine est de loin le plus grand centre de formation en pédiatrie au Québec et un chef de file au Canada; il accueille chaque année plus de 4 000 étudiants et stagiaires.

Description du poste :

Description du poste :
La plateforme de bio-informatique appliquée en oncogénomique du Centre de recherche du CHU Sainte Justine est à la recherche de candidats au poste d’assistant de recherche en bio-informatique. Les principales tâches consistent à offrir un support bio-informatique aux usagers pour l’analyse de données de séquençage nouvelle-génération, couvrant tout le spectre des analyses bio-informatiques (primaires, secondaires et tertiaires). Le candidat sera en charge de la génération, du contrôle de qualité des données, de l’annotation de génomes/transcriptomes (ChIP-seq, WGBS, RRBS, etc.) et de l’interprétation biologique de résultats en collaboration avec les utilisateurs de la plateforme.
La plateforme de bio-informatique appliquée en oncogénomique a pour objectifs principaux 1) de consolider et développer l'expertise locale en génomique du cancer et en bio-informatique appliquée; 2) de développer des méthodes et outils qui seront exploités pour l’analyse de données biologiques. En lien avec ces objectifs, le candidat aura aussi pour tâche de s’assurer du transfert efficace de l’information et des résultats aux chercheurs/utilisateurs de la plateforme en regard aux données de séquençage analysées.
Sommaire des responsabilités :
• Effectuer des analyses complexes à partir de jeux de données génomiques;
• Effectuer des analyses statistiques avancées pour faciliter l'interprétation des données génomiques;
• Mener plusieurs projets de front;
• Former les usagers aux analyses bio-informatiques de base;
• Discuter de l’avancement des projets lors de réunions statutaires et ad hoc;
• Contribuer techniquement et intellectuellement aux objectifs du laboratoire;
• Contribuer à la préparation de manuscrits;
• Rester à jour avec les bonnes pratiques bio-informatiques en génomique;
• Toute autre activité connexe assignée par le gestionnaire de la plateforme.

Exigences :

Qualités et compétences requises :
• M.Sc. en bio-informatique ou B.Sc. en bio-informatique avec expérience pertinente (génomique, informatique, génie logiciel, etc.);
• Expérience dans l'analyse des données de séquençage à haut débit (transcriptome, exome) et maîtrise des suites d'outils (GATK, etc.) et des bases de données dédiées;
• Excellente maîtrise d'au moins un langage de script (Python, Perl, BASH);
• Compétence en analyses statistiques avec R;
• Excellente maîtrise de l'environnement UNIX;
• Expertise en programmation WEB et en système de gestion de base un atout.
• Autonomie, dynamisme et curiosité scientifique;
• Excellente capacité d’analyse et de synthèse;
• Sens de l’initiative et de l’organisation;
• Facilité à travailler en équipe pluridisciplinaire;
• Maîtrise du français et de l’anglais (parlé et écrit);

Conditions d’emploi

Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)
Échelle salariale : Niveau 2 - entre 22.54$/hr et 32.98$/hr
Chercheur responsable: Dr Daniel Sinnett
Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
Date prévue d’entrée en fonction : Immédiate

Remarques :

Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but d’alléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe d'accès à l'égalité en emploi et invite les femmes, les membres des minorités visibles et des minorités ethniques, les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.

Autres avantages :

SERVICES DISPONIBLES SUR PLACE:
Caisse d’économie Desjardins;
Pharmacie Jean Coutu;
Bistro ;
Nettoyeur et couturière;
Activités sportives en gymnase et à l’extérieur;
À 2 pas du métro Université de Montréal et de stations BIXI;
Près des rues commerciales : terrasses, librairies, pâtisseries.
FAIRE CARRIÈRE CHEZ NOUS C’EST :
- Contribuer à une mission humaine qui a pour but d’améliorer la santé des mères et des enfants du Québec;
- S’investir avec une équipe de travail innovatrice, motivée par des projets en constante évolution;
- Avoir la possibilité de se réaliser à travers des défis stimulants;
- S’offrir une carrière à la hauteur de ses compétences dans un milieu constamment en mouvement;
- Évoluer dans une organisation qui valorise l’amélioration continue;
- Se réaliser professionnellement grâce aux multiples possibilités de développement.